GenoSuite
| Versija | 2.0.1 |
|---|---|
| Leidėjas | Dhirendra Kumar |
| Išleidimo data | 2013-05-02 |
| Data pridėta | 2013-05-02 |
| OS reikalavimai | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Reikalavimai | None |
| Iš viso atsisiuntimų | 22 |
| Kaina | Free |
apibūdinimas
GenoSuite yra sistema, sukurta proteogenominei analizei. FDRScore pagrįsta strategija naudojama rezultatams iš kelių paieškos algoritmų integruoti. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) sukurtas kaip GenoSuite sistemos dalis. PPT skirtas naujiems vertimams prokariotiniuose genomuose rasti ir priklauso nuo masės spektrometrija pagrįstų proteomikos duomenų ir susijusios genomo sekos. Funkcijos apima 4 atvirojo kodo algoritmus, sukonfigūruotus 4 atvirojo kodo algoritmams, kad būtų galima atlikti peptidų identifikavimo paiešką duomenų bazėje, ir galima pasirinkti bet kurį 4 algoritmų derinį, pateikiami genomo paieškos specifiniai peptidai (nauji peptidai), spektrinės atitikties gali būti vizualizuojamos kokybės įvertinimui, pateikiami sąrašai. Taip pat galima sukurti naujus baltymus ir esamų baltymų anotacijų pokyčius bei vizualinį naujų peptidų genominį kontekstą.